où il signe un contrat de quatre ans. À Hambourg , il retrouve la Championnat d'Allemagne de football Bundesliga , et intègre un club qui joue les places européennes. Sous la direction de l'entraîneur Pays-Bas néerlandais Martin Jol , Pitroipa peine à s'imposer dans l'équipe hambourgeoise, n'étant titularisé que lors de la moitié de ses apparitions en championnat, lors de la Saison 2008-20en football contre le TSG 1899 Hoffenheim TSG Hoffenheim , et ne donne qu'une passe décisive en
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De retour en Allemagne, il parvient une nouvelle fois avec Hambourg en demi-finale de la Ligue Europa 2009-2010 Ligue Europa , et est cette fois éliminé par les Angleterre Anglais de Fulham Football Club Fulham
Pitroipa peine toujours à s'imposer lors de la Saison 2009-2010 du Hambourg SV saison 2009-2010 , alors que Bruno Labbadia a remplacé Martin Jol à la tête du HSV. N'étant toujours titularisé que lors de la moitié de ses apparitions en championnat, il marque trois buts et offre une passe décisive en
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Pitroipa dispute sa première rencontre officielle avec le Stade rennais le date sport en football , à l'occasion d'un déplacement à Tbilissi , en Ligue Europa 2011-2012 Ligue Europa , face au Football Club Rustavi Metallurgist Rustavi Metallurgist
Titulaire régulier jusqu'en date janvier 2011 , il marque deux buts et donne sept passes décisives en
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Jonathan est en pause
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jusqu'à son décès en date janvier 2014 Jonathan est en pause